El 28 de octubre de 1538 la bula papal Apostolatus Culmine autoriza la creación de la Universidad de Santo Tomás de Aquino. Su primera sede en América fue establecida en la ciudad de Santo Domingo, capital de República Dominicana, convirtiéndose en la decana del continente. Actualmente es sitio de estudio de unos 165.000 estudiantes y ha abandonado el carácter clerical en noviembre desde 1914, para convertirse en un centro autónomo de enseñanza. La universidad peruana de San Marcos, fundada en Lima el 12 de mayo de 1551, reclama también ser la primera del Nuevo Mundo.
