A partir de la segunda guerra, 1857-1860, Ecuador volvió a mover el problema al querer entregar a Inglaterra tierras peruanas de la amazonía, un millón de cuadras cuadradas (qué clase de medida es esta-) sobre los márgenes del río Bombonaza (Ecuador), habla de la existencia de un documento firmado por representantes de los dos países, el Perú desconocía la existencia de dicho documento y de que no existía la gran Colombia. La armada peruana fue al norte y bloqueó Guayaquil, Castilla presidente por entonces desembarcó cerca de Guayaquil y ocupó alturas de Mapasingue, en 1860, llegó a ocupar Guayaquil sin disparar ni un tiro y llamó al trato. Así se firmó el tratado de Mapasingue, el 25 de enero de 1860, que es favorable al Perú, pues quedó reconocida su frontera, deslindándose claramente solo parte de Tumbes y la de Jaén, es decir, la parte más cercanamente a la costa, y lo que era territorio de Maynas (provincia peruana que limita por el Oeste con Ecuador).
